Elle regroupait 4 départements : Territoire de Belfort, Doubs, Jura et Haute-Saône.
L'histoire de la Franche-Comté est complexe, en partie à cause de sa position frontalière (frontière avec la Suisse). Elle fut rattachée au duché de Bourgogne en 1384, passa sous domination espagnole en 1556 et devint une province française en 1678.